El año 2000 el INS “Juan Misael Saracho”, pasa a la administración de la Universidad Católica Boliviana, (U.C.B.), la misma que inicia sus actividades académicas con las carrera de Inicial, primaria, matemática y Lenguaje para el nivel primario (ciclo intermedio), Matemática, Lenguaje y comunicación del nivel secundario, por un periodo de 5 años. A partir del 2006, el INS “Juan Misael Saracho”, vuelve a tuición del Ministerio de Educación con las mismas carreras que la U.C.B. implementó en su administración, estas son: Nivel inicial, primaria, lenguaje y matemática de primaria, y las especialidades de matemática, Lenguaje y comunicación de secundaria, posteriormente en forma sucesiva se aumenta las carreras de Física-química, Biología, música, en el sistema semestralizado. En el mes agosto del 2008, mediante Resolución Ministerial Nº 664/08 se autoriza el funcionamiento de la Unidad Académica del Gran Chaco, con la especialidad de Lenguas Nativas, (Guaraní), y se aumenta la especialidad de Ciencias Sociales. La Unidad Académica Tarija, creada con R.M. Nº 665/08, con las especialidades de Estudios sociales y Artes Plásticas inicialmente y se adiciona la especialidad de Lenguaje y comunicación. El 6 de junio del 2009 mediante Decreto Supremo Nº 156, el gobierno actual, crea el Sistema Plurinacional de Formación Docente, transformando los Institutos Normales Superiores del país en Escuelas de Formación de Maestros y el año 2010 se inicia el nuevo sistema anual de formación de maestros en la ESFM “ Juan Misael Saracho”, con las siguientes carreras: Educación Inicial en Familia comunitaria, Educación primaria comunitaria vocacional, especialidades de secundaria de Matemática, Biología, Física-Química, Cosmovisiones, filosofía y Psicología y Música, Educación Física y Deportes, para primaria y secundaria. Actualmente la ESFM “Juan Misael Saracho”, con sus dos unidades académicas de Tarija y el Gran Chaco, cuenta con todas las carreras docentes, encontrándose entre las ESFM mas importantes del país. La Escuela Normal Rural "Juan Misael Saracho", hoy llamada Escuela Superior de Formación de Maestros “Juan Misael Saracho”(ESFM “JMS”), el 25 de abril de 2021 ha cumplido 83 años al servicio de la Educación; durante este tiempo ha prestado invaluables servicios a la sociedad del departamento y del país, formando en sus aulas a insignes profesionales de la educación que se destacaron también como Autoridades Educativas, Representantes Nacionales, Alcaldes Municipales, Diplomáticos y Periodistas.